Plan détaillé
Chapitre I : Principales bactéries pathogènes pour l’homme (caractères généraux et pouvoir pathogène)
1- Cocci à Gram positif : Staphylocoques, Streptocoques, Pneumocoques, Enterocoques
2- Cocci à Gram négatif : Neisseria meningitidis, Neisseria gonohoree
3- Bacilles à Gram positif sporulés : Clostridiun tetani, clostridium perfringens
4- Bacilles à Gram positif non sporulés : Corynebacterium diphteriae
5- Mycobactéries : Mycobactrium tuberculosis, mycobactéries atypiques
Chapitre II : Méthodes de diagnostic des produits pathologiques.
1- Examen cytobactériologique des urines
1-1 Examen macroscopique
1-2 Examen cytologique qualitatif et quantitatif (leucocytes, hématies, cylindres, cristaux)
1-3 Examen bactériologique
2- Examen bactériologique des selles (Coproculture)
2-1 Examen direct
2-2 Milieux utilisés et ensemencement
2-3 Méthode
3- Examen bactériologique du sang (Hémoculture)
3-1 Hémoculture sur milieu Castaneda
3-2 Caillot culture
4- Examen des secrétions broncho pulmonaires
4-1 Coloration de Ziehl Neelsen
4-2 Coloration à l’auramine
4-3 Mise en culture
5- Examen cyto- bactériologique et biochimique du liquide céphalo- rachidien
5-1 Examen macroscopique du LCR
5-2 Examen cytologique qualitatif et quantitatif
5-3 Examen microscopique
5-4 Mise en culture des bactéries trouvées.
Chapitre III : L’identification bactérienne et l’antibiogramme.
1- L’identification bactérienne
1-1- Les techniques classiques d’identification bactérienne
1-1-1- Identification microscopique
1-1-2- Cytologie
1-1-3- Coloration de Gram
1-2- Identification après culture bactérienne (colonies)
1-3- Identification biochimique
1-3-1- Galerie classique
1-3-2- Galerie API
2- L’antibiogramme
2-1- Techniques de diffusion en milieu gélosé
2-2- Techniques de la détermination de CMI
3- Les nouvelles techniques d’imagerie et d’intelligence artificielle utilisées pour l’identification bactérienne et l’antibiogramme (Approches innovantes).
3-1- L’automatisation et l’application de l’intelligence artificielle
- Sysmex UF-4000 (cytologie et une indication rapide du Gram)
- La spectrométrie de masse MALDI TOF (identification bactérienne)
- L’automate BioKube : Une identification bactérienne sur colonie par diffraction LASER.
- Vitek2-Compact15 (antibiogramme)
Chapitre IV : Épidémiologie
1-Définition
2- Vocabulaire en épidémiologie
3-Les objectifs de l’épidémiologie
4-Branches de l’épidémiologie
A-Épidémiologie descriptive
B-Épidémiologie analytique
C-Épidémiologie évaluative
5-Les différents types d'études épidémiologiques
A- Les études expérimentales
B- Les études non expérimentales
6- Exemple de la pandémie du COVID-19 et son impact socio-économique
6-1- Situation épidémiologique du COVID-19 en Algérie.
- Morbidité
- Mortalité
6-2- Les conséquences socio-économiques de la crise du COVID-19.
- L’impact économique (activité économique et emploi).
- L’impact social (Les secteurs sociaux : la santé et de l’éducation)